Menjadi fakultas unggul bertaraf Internasional yang menghasilkan lulusan kompeten untuk mengembangkan IPTEKS dan budaya di bidang kedokteran dan ilmu kesehatan bagi kemaslahatan umat yang berlandaskan Islam Ahlusunnah Waljama’ah
Melalui pengajaran, pembelajaran, penelitian, dan pengabdian masyarakat, FK UNISMA mempengaruhi kesehatan manusia Indonesia secara individual, komunitas maupun global.
Kurikulum pendidikan di FK UNISMA berorientasi pada konsep aqidah Islam sebagai dasar pengembangan kajian keilmuan melalui implementasi nilai-nilai Islam dalam 10 karakter dokter muslim yang dapat diterapkan dalam berbagai aspek kehidupan baik semasa pendidikan maupun saat melaksanaan profesi sebagai tenaga kesehatan.